台風6号は3日午前4時半ごろ、和歌山県南部に上陸した。気象庁は同県南部を流れる古座川について、レベル5氾濫特別警報を出した。レベル5は命の危険が迫っている段階で、「何らかの災害が既に発生している可能性が極めて高い」として、同庁は身の安全を確保するよう呼びかけた。5月に新たな防災気象情報が始まって以来、特別警報の発表は初めて。上陸が6月に記録されたのは、2012年以来となる。
気象庁によると、古座川では越水による氾濫を確認した。24時間降水量は三重県尾鷲市で500ミリ超、徳島県上勝町や高知県四万十町などで400ミリ超を観測した。
台風6号は午前5時現在、和歌山県・潮岬付近を時速約40キロの速さで東北東へ進んだ。中心気圧は980ヘクトパスカルで最大風速は25メートル、最大瞬間風速は35メートル。
東日本や西日本の太平洋側では大雨となる見込みで、4日午前6時までに24時間予想降水量は多い所で、東北地方120ミリ、関東甲信地方200ミリ、東海地方200ミリ。